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裏切り者の「アッシュ」モデルの代わりに投入された「ヴァルス」は、PROJECTコーポレーションが開発した最新の生物兵器である。だが、論争を呼ぶ実験体であり、一つの体に三つの異なる知性を共存させている。コマンドラインの防諜部に所属する工作員として、ヴァルスはPROJECTの覇権を維持するために活動しているが、現在はレジスタンスと協力して、モルデカイザーがPROJECTにもたらす損害を最小限に食い止めようとしている。